論文

基本情報

氏名 宮田 大輔
氏名(カナ) ミヤタ ダイスケ
氏名(英語) MIYATA, Daisuke
所属 商経学部
職名 教授
researchmap研究者コード
researchmap機関

題名

HGT-Gen: a tool for generating a phylogenetic tree with horizontal gene transfer

単著・共著の別

共著

概要

T. Horiike, D. Miyata, Y. Tateno, R. Minai  タンパク質あるいは遺伝子のオリジナルの系統樹をもとに,遺伝子水平伝達を発生させた系統樹を生成するプログラムHGT-Genを開発した。HGT-Genは与えられた系統樹の分類操作単位をある場所から別の場所に移し替えることで水平伝達をシミュレートする。さらに,系統樹の任意の枝の間の平均長を計算するためのアルゴリズムを考案し,相対的な進化の時間を定義した。

発行雑誌等の名称

Bioinformation, 7(5), 211-213

巻・号・掲載ページ(移行用)

発行又は発表の年月

2011/10