Academic Theses

Basic information

Name MIYATA, Daisuke
Belonging department
Occupation name
researchmap researcher code
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Title 

HGT-Gen: a tool for generating a phylogenetic tree with horizontal gene transfer

					

					

						

							

								

									
Bibliography　Type 

									
								

							

						

						
Joint Author

					

					

						

							

								

									
Summary 

									
								

							

						

						
T. Horiike, D. Miyata, Y. Tateno, R. Minai　　タンパク質あるいは遺伝子のオリジナルの系統樹をもとに，遺伝子水平伝達を発生させた系統樹を生成するプログラムHGT-Genを開発した。HGT-Genは与えられた系統樹の分類操作単位をある場所から別の場所に移し替えることで水平伝達をシミュレートする。さらに，系統樹の任意の枝の間の平均長を計算するためのアルゴリズムを考案し，相対的な進化の時間を定義した。

					

					

						

							

								

									
Magazine(name) 

									
								

							

						

						
Bioinformation, 7(5), 211-213

					

					

						

							

								

									
Volume 

									
								

							

						

						

					

					

						

							

								

									
Date of Issue 

									
								

							

						

						
2011/10