Development of new method for constructing ortholog dataset using large amount of gene data

SMBE2011-Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, Kyoto Japan

T. Horiike, R. Minai, D. Miyata, Y. Tateno　　オーソログデータベースはタンパク質機能の予測に役立つが，パラログおよび水平伝達遺伝子がデータセットに含まれているために，系統発生解析には適さない。そこで，水平伝達に由来する遺伝子の削除，アウトパラログの削除，系統樹分割，閾値の変更というアイデアをを導入したオーソログデータセットを構築する方法を開発した。