HGT-Gen: a tool for generating a phylogenetic tree with horizontal gene transfer

T. Horiike, D. Miyata, Y. Tateno, R. Minai　　タンパク質あるいは遺伝子のオリジナルの系統樹をもとに，遺伝子水平伝達を発生させた系統樹を生成するプログラムHGT-Genを開発した。HGT-Genは与えられた系統樹の分類操作単位をある場所から別の場所に移し替えることで水平伝達をシミュレートする。さらに，系統樹の任意の枝の間の平均長を計算するためのアルゴリズムを考案し，相対的な進化の時間を定義した。

Bioinformation, 7(5), 211-213